La Santa Sede aceptó la petición que la Conferencia Episcopal Española junto con la Fraternidad Agustina Española (FAE) presentaron en abril de 2016 para nombrar a Santo Tomás de Villanueva a Doctor de la Iglesia.
La Iglesia reconoce con el título de Doctor de la Iglesia a quienes han sido eminentes maestros de la fe para los fieles de todos los tiempos, influyendo de manera especial sobre el desarrollo del cristianismo, sentando las bases de la doctrina o interpretando de manera esclarecedora algunos aspectos de la fe.
La Fraternidad Agustina Española informó en un comunicado que el proceso del nombramiento de Santo Tomás de Villanueva como Doctor de la Iglesia sigue adelante tras la decisión de la Santa Sede de estudiar la obra de este santo español para determinar si es "eminente y su testimonio relevante", un requisito indispensable para ser nombrado Doctor de la Iglesia.