Tras la noticia de la muerte del líder palestino Yasser Arafat en un hospital de París, el director de la Oficina de Prensa vaticana, Joaquín Navarro-Valls, manifestó el dolor de la Santa Sede y el deseo de que Dios conceda la paz a Tierra Santa,  “con dos estados independientes y soberanos, plenamente reconciliados entre sí”.

"La Santa Sede se une al dolor del pueblo palestino por la desaparición del presidente Yasser Arafat. Fue un líder de gran carisma, que amó a su pueblo e intentó guiarlo hacia la independencia nacional”, manifestó Navarro-Valls en un comunicado.

“¡Que Dios acoja en su misericordia el alma del ilustre difunto y conceda la paz a Tierra Santa, con dos estados independientes y soberanos, plenamente reconciliados entre sí!", concluyó.

Santa Sede y autoridades palestinas

Juan Pablo II y Yasser Arafat se encontraron en 12 ocasiones durante los 26 años de pontificado del Santo Padre. Arafat fue recibido 11 veces en el Vaticano: la primera el 15 de septiembre de 1982 y la última el 30 de octubre de 2001. El líder palestino y el Santo Padre se encontraron también en Belén durante la peregrinación del Papa a Tierra Santa en marzo de 2000.

Por su parte, Arafat se entrevistó con el Cardenal Angelo Sodano, secretario de Estado en 1996, con el Arzobispo y ahora Cardenal Jean-Louis Tauran, secretario para las Relaciones con los Estados en Túnez (1994) y en Gaza (1995) y con el Cardenal Pio Laghi, cuando visitó Tierra Santa en 2001.

El 25 de octubre de 1994 la Santa Sede anunció que la Organización para la Liberación de Palestina (OLP) y la Santa Sede intercambiarían representantes para "abrir canales y continuar el desarrollo de relaciones mutuas, comprensión y cooperación. Se ha decidido dar a los fructíferos contactos que ya existían desde hace tiempo, un carácter permanente y oficial”. La OLP, por su parte, “abrirá una oficina de representación ante la Santa Sede, con su director propio. El nuncio apostólico en Túnez será el responsable de los contactos con los dirigentes de la Organización para la Liberación de Palestina".

El 15 de febrero de 2000, Juan Pablo II recibió a Arafat y a una delegación para la firma de un acuerdo de base entre la Santa Sede y la OLP, en calidad de representante de la Autoridad Nacional Palestina. En aquella ocasión Arafat invitó a Juan Pablo II a Belén. El acuerdo firmado ese día se centraba en diversas cuestiones jurídicas relativas a la presencia y actividad de la Iglesia Católica en el territorio dependiente de la Autoridad Palestina.