6. Fue convertida en una mezquita en 1453
Constantinopla cayó el 29 de mayo de 1453 en manos del ejército otomano, que bajo el mando del sultán Mehmet II, violaron y mataron a los habitantes y saquearon la ciudad.
Mehmet II declaró que Santa Sofía en adelante serviría como la mezquita principal de su nueva capital. Ordenó que los mosaicos fueran cubiertos de yeso y luego decorados con caligrafía y diseños islámicos. El sultán completó la conversión de la iglesia con la instalación de un minbar (púlpito), mihrab (nicho de oración) y una fuente para lavar. Durante los siglos siguientes se agregaron cuatro minaretes para la llamada a la oración en las cuatro esquinas del edificio.
Además de las imágenes cubiertas, el cambio más significativo en el interior fue la instalación de ocho enormes medallones en las columnas de la nave, que se agregaron durante las renovaciones entre 1847 y 1849, y muestran los nombres de Alá y Muhammad, los primeros cuatro califas Abu Bakr, Umar, Uthman y Ali, y los nietos de Muhammad Hassan y Hussein.