El Papa Juan Pablo II concluyó la homilía de la Misa por su 25º aniversario con una sentida oración dirigida al Señor Jesús en el que ofrece a Dios todos los frutos de su Pontificado y renovó su entrega por la Iglesia:
A ti, Señor Jesucristo,
Único Pastor de la Iglesia,
ofrezco los frutos de estos 25 años de ministerio
al servicio del pueblo que me has confiado.
Perdona el mal realizado y multiplica el bien:
Todo es obra tuya y sólo a Ti se debe la gloria.

Con plena confianza en tu misericordia,
Te vuelvo a presentar nuevamente hoy a aquellos que años atrás
has confiado a mis cuidados pastorales.
Consérvalos en el amor, reúnelos en tu rebaño,
toma sobre tus espaldas a los débiles,
cura a los heridos, cuida a los fuertes.

Que Tú seas su Pastor, para que no se dispersen.
Protege a la querida Iglesia que está en Roma
y las Iglesias del mundo entero.
Inunda con la luz y la potencia de tu Espíritu
a cuantos has puesto a la cabeza de tu grey:
que cumplan con arrojo su misión
de guías, maestros y santificadores,
en la espera de tu retorno glorioso.

Te renuevo, por las manos de María, Madre amada,
el don de mí mismo, del presente y del futuro:
que todo se cumpla según tu voluntad.
Pastor Supremo, quédate en medio de nosotros,
para que podamos contigo avanzar seguros,
hacia la casa del Padre. ¡Amén!

Al finalizar la Misa, el Papa saludó a todos los presentes, a los jefes de estado, "especialmente al Presidente de Polonia así como al Presidente de Italia Carlo Ciampi, a quienes agradezco por las corteses expresiones de saludo que me dirigieron ayer"; y ofreció breves saludos en francés, inglés, alemán, español, portugués, bielorruso y polaco.